Merupakan salah satu program utama Balai Penerapan Standar Instrumen Pertanian dalam menjamin mutu keamanan pangan dan meningkatkan daya saing produk pertanian melalui ketersediaan benih/bibit terstandar dan bersertifikat. BPSIP Riau memiliki sarana, prasarana, serta sumber daya manusia yang handal dan terampil dalam melaksanakan produksi benih/bibit tanaman pangan, hortikultura, perkebunan dan peternakan untuk mendukung capaian produksi nasional.
Pada tahun 2024 BPSIP Riau melaksanakan kegiatan Perbenihan Padi dengan target 18 ton. Kegiatan dilaksanakan di Kabupaten Siak seluas 10 ha dan Perbenihan jagung dengan target 5 ton.